תחזוקה שוטפת כוללת ניקיון ובדיקות בסיסיות, וכן בדיקות של מערכת ההתזה להבטחת פיזור אחיד וחופש מחסימות. תהליך התחזוקה המקיף של מגדלי הקירור מחולק לשלושה שלבים נפרדים: ניקיון ושירות לאחר השבתה; בדיקה והפעלה לפני-הפעלה; ובדיקות תקופתיות במהלך פעולה רגילה.
פעולות התחזוקה חייבות להתבצע על פי מחזור מתוכנן, המכסה משימות כגון שימון רכיבי ההנעה, ניקוי מערכת פיזור החום וניקוי אגן המים. תחזוקת מערכת ההנעה כוללת החלפת מנוע ושיפוץ, התאמה והחלפה של רצועות מפחיתות, החלפת מיסבי מפחית ואטמי פיר, תיקון בית התמיכה הבינוני של המפחית, החלפה ואיזון דינמי של מכלול המאוורר ויישור גל ההנעה. תחזוקה של מערכת פיזור החום כוללת ניקוי והחלפת חרירי חלוקת מים וחומרי מילוי, וכן ניקוי שקתות חלוקה וצנרת ריסוס; הוא כולל גם החלפה והתאמה של ראשי ריסוס אוטומטיים. שיטות ניקוי ידני מסורתיות מהוות סיכוני בטיחות משמעותיים-כגון נפילות מגובה, חנק והחלקות-ומציעות יעילות מוגבלת; שיטות ניקוי מכניות מודרניות, לעומת זאת, משתמשות בטכנולוגיות כמו-הזרקת מים בלחץ גבוה והסרת בוצה רובוטית. תחזוקת מדור אגן המים כוללת ניקוי כללי של האגן, איתור ותיקון נזילות וניקוי או החלפה של מסכי כניסת אוויר.
תחזוקה לתנאי הפעלה מיוחדים
כדי למנוע הקפאה של רכיבי חילופי החום והמים במחזור, ניתן להוסיף חומרי מניעת קיפאון למים הזורמים, או להתקין מחממי עזר חשמליים בתוך מערכת הצנרת.
